Protein–RNA interactions for Protein: P48739

PITPNB, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNBP48739 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms