Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PIP4K2AP48426 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PIP4K2AP48426 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PIP4K2AP48426 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PIP4K2AP48426 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PIP4K2AP48426 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PIP4K2AP48426 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PIP4K2AP48426 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PIP4K2AP48426 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PIP4K2AP48426 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PIP4K2AP48426 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PIP4K2AP48426 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PIP4K2AP48426 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PIP4K2AP48426 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PIP4K2AP48426 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PIP4K2AP48426 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PIP4K2AP48426 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PIP4K2AP48426 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PIP4K2AP48426 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PIP4K2AP48426 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PIP4K2AP48426 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PIP4K2AP48426 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PIP4K2AP48426 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PIP4K2AP48426 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PIP4K2AP48426 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PIP4K2AP48426 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PIP4K2AP48426 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PIP4K2AP48426 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PIP4K2AP48426 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PIP4K2AP48426 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PIP4K2AP48426 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PIP4K2AP48426 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PIP4K2AP48426 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PIP4K2AP48426 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PIP4K2AP48426 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PIP4K2AP48426 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PIP4K2AP48426 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PIP4K2AP48426 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PIP4K2AP48426 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PIP4K2AP48426 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PIP4K2AP48426 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PIP4K2AP48426 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PIP4K2AP48426 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PIP4K2AP48426 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PIP4K2AP48426 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PIP4K2AP48426 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PIP4K2AP48426 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PIP4K2AP48426 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PIP4K2AP48426 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PIP4K2AP48426 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PIP4K2AP48426 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PIP4K2AP48426 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PIP4K2AP48426 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PIP4K2AP48426 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PIP4K2AP48426 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIP4K2AP48426 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIP4K2AP48426 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIP4K2AP48426 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIP4K2AP48426 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIP4K2AP48426 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIP4K2AP48426 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIP4K2AP48426 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIP4K2AP48426 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIP4K2AP48426 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIP4K2AP48426 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIP4K2AP48426 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIP4K2AP48426 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIP4K2AP48426 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIP4K2AP48426 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIP4K2AP48426 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIP4K2AP48426 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PIP4K2AP48426 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PIP4K2AP48426 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIP4K2AP48426 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PIP4K2AP48426 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIP4K2AP48426 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIP4K2AP48426 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIP4K2AP48426 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIP4K2AP48426 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIP4K2AP48426 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIP4K2AP48426 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIP4K2AP48426 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIP4K2AP48426 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIP4K2AP48426 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIP4K2AP48426 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIP4K2AP48426 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIP4K2AP48426 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIP4K2AP48426 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIP4K2AP48426 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIP4K2AP48426 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PIP4K2AP48426 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIP4K2AP48426 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PIP4K2AP48426 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIP4K2AP48426 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIP4K2AP48426 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIP4K2AP48426 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIP4K2AP48426 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIP4K2AP48426 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PIP4K2AP48426 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PIP4K2AP48426 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms