Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GRIA4P48058 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms