Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CNGA1P29973 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CNGA1P29973 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CNGA1P29973 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CNGA1P29973 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CNGA1P29973 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CNGA1P29973 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CNGA1P29973 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CNGA1P29973 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CNGA1P29973 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CNGA1P29973 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CNGA1P29973 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CNGA1P29973 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CNGA1P29973 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CNGA1P29973 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CNGA1P29973 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CNGA1P29973 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CNGA1P29973 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CNGA1P29973 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CNGA1P29973 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CNGA1P29973 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CNGA1P29973 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CNGA1P29973 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CNGA1P29973 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CNGA1P29973 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CNGA1P29973 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CNGA1P29973 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CNGA1P29973 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CNGA1P29973 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CNGA1P29973 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CNGA1P29973 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CNGA1P29973 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CNGA1P29973 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CNGA1P29973 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CNGA1P29973 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CNGA1P29973 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CNGA1P29973 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CNGA1P29973 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CNGA1P29973 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CNGA1P29973 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CNGA1P29973 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CNGA1P29973 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CNGA1P29973 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CNGA1P29973 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CNGA1P29973 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CNGA1P29973 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CNGA1P29973 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CNGA1P29973 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CNGA1P29973 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CNGA1P29973 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CNGA1P29973 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CNGA1P29973 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CNGA1P29973 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CNGA1P29973 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CNGA1P29973 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CNGA1P29973 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CNGA1P29973 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CNGA1P29973 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CNGA1P29973 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CNGA1P29973 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CNGA1P29973 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CNGA1P29973 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CNGA1P29973 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CNGA1P29973 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CNGA1P29973 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CNGA1P29973 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CNGA1P29973 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CNGA1P29973 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CNGA1P29973 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CNGA1P29973 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CNGA1P29973 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CNGA1P29973 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CNGA1P29973 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CNGA1P29973 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CNGA1P29973 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CNGA1P29973 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CNGA1P29973 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CNGA1P29973 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CNGA1P29973 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CNGA1P29973 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CNGA1P29973 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CNGA1P29973 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CNGA1P29973 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CNGA1P29973 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CNGA1P29973 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CNGA1P29973 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CNGA1P29973 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CNGA1P29973 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CNGA1P29973 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CNGA1P29973 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CNGA1P29973 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CNGA1P29973 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CNGA1P29973 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CNGA1P29973 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CNGA1P29973 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CNGA1P29973 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CNGA1P29973 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CNGA1P29973 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CNGA1P29973 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CNGA1P29973 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms