Protein–RNA interactions for Protein: P29762

CRABP1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRABP1P29762 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRABP1P29762 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRABP1P29762 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRABP1P29762 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRABP1P29762 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRABP1P29762 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRABP1P29762 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRABP1P29762 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRABP1P29762 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRABP1P29762 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CRABP1P29762 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRABP1P29762 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRABP1P29762 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRABP1P29762 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRABP1P29762 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRABP1P29762 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRABP1P29762 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CRABP1P29762 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRABP1P29762 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRABP1P29762 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRABP1P29762 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRABP1P29762 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRABP1P29762 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRABP1P29762 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CRABP1P29762 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRABP1P29762 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRABP1P29762 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRABP1P29762 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CRABP1P29762 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRABP1P29762 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRABP1P29762 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRABP1P29762 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRABP1P29762 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRABP1P29762 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRABP1P29762 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRABP1P29762 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRABP1P29762 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRABP1P29762 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRABP1P29762 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRABP1P29762 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRABP1P29762 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRABP1P29762 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CRABP1P29762 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRABP1P29762 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRABP1P29762 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRABP1P29762 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRABP1P29762 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRABP1P29762 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRABP1P29762 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRABP1P29762 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRABP1P29762 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRABP1P29762 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRABP1P29762 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRABP1P29762 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRABP1P29762 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRABP1P29762 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRABP1P29762 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRABP1P29762 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRABP1P29762 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRABP1P29762 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRABP1P29762 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRABP1P29762 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRABP1P29762 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRABP1P29762 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRABP1P29762 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRABP1P29762 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRABP1P29762 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRABP1P29762 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRABP1P29762 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRABP1P29762 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRABP1P29762 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRABP1P29762 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRABP1P29762 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRABP1P29762 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRABP1P29762 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRABP1P29762 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRABP1P29762 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRABP1P29762 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRABP1P29762 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRABP1P29762 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRABP1P29762 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRABP1P29762 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRABP1P29762 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRABP1P29762 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRABP1P29762 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRABP1P29762 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRABP1P29762 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRABP1P29762 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRABP1P29762 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRABP1P29762 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRABP1P29762 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRABP1P29762 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRABP1P29762 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRABP1P29762 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CRABP1P29762 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRABP1P29762 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRABP1P29762 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRABP1P29762 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRABP1P29762 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CRABP1P29762 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms