Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
POLR2AP24928 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
POLR2AP24928 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
POLR2AP24928 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
POLR2AP24928 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
POLR2AP24928 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
POLR2AP24928 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
POLR2AP24928 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
POLR2AP24928 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
POLR2AP24928 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
POLR2AP24928 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
POLR2AP24928 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
POLR2AP24928 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
POLR2AP24928 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
POLR2AP24928 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
POLR2AP24928 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
POLR2AP24928 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
POLR2AP24928 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
POLR2AP24928 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
POLR2AP24928 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
POLR2AP24928 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
POLR2AP24928 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
POLR2AP24928 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
POLR2AP24928 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
POLR2AP24928 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
POLR2AP24928 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
POLR2AP24928 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
POLR2AP24928 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
POLR2AP24928 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
POLR2AP24928 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
POLR2AP24928 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
POLR2AP24928 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
POLR2AP24928 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
POLR2AP24928 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
POLR2AP24928 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
POLR2AP24928 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
POLR2AP24928 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
POLR2AP24928 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
POLR2AP24928 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
POLR2AP24928 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
POLR2AP24928 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
POLR2AP24928 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
POLR2AP24928 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
POLR2AP24928 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
POLR2AP24928 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
POLR2AP24928 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
POLR2AP24928 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
POLR2AP24928 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
POLR2AP24928 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
POLR2AP24928 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
POLR2AP24928 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
POLR2AP24928 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
POLR2AP24928 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
POLR2AP24928 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
POLR2AP24928 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
POLR2AP24928 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
POLR2AP24928 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
POLR2AP24928 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
POLR2AP24928 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
POLR2AP24928 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
POLR2AP24928 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
POLR2AP24928 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
POLR2AP24928 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
POLR2AP24928 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
POLR2AP24928 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
POLR2AP24928 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
POLR2AP24928 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
POLR2AP24928 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
POLR2AP24928 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
POLR2AP24928 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
POLR2AP24928 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
POLR2AP24928 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
POLR2AP24928 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
POLR2AP24928 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
POLR2AP24928 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
POLR2AP24928 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
POLR2AP24928 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
POLR2AP24928 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
POLR2AP24928 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
POLR2AP24928 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
POLR2AP24928 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
POLR2AP24928 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
POLR2AP24928 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
POLR2AP24928 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
POLR2AP24928 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
POLR2AP24928 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
POLR2AP24928 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
POLR2AP24928 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
POLR2AP24928 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
POLR2AP24928 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
POLR2AP24928 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
POLR2AP24928 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
POLR2AP24928 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
POLR2AP24928 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
POLR2AP24928 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
POLR2AP24928 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
POLR2AP24928 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
POLR2AP24928 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
POLR2AP24928 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
POLR2AP24928 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms