Protein–RNA interactions for Protein: P23511

NFYA, Nuclear transcription factor Y subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFYAP23511 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NFYAP23511 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NFYAP23511 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NFYAP23511 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NFYAP23511 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NFYAP23511 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NFYAP23511 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NFYAP23511 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NFYAP23511 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NFYAP23511 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NFYAP23511 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NFYAP23511 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NFYAP23511 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NFYAP23511 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NFYAP23511 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NFYAP23511 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NFYAP23511 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NFYAP23511 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NFYAP23511 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NFYAP23511 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NFYAP23511 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NFYAP23511 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NFYAP23511 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NFYAP23511 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NFYAP23511 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NFYAP23511 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NFYAP23511 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NFYAP23511 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NFYAP23511 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NFYAP23511 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NFYAP23511 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NFYAP23511 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NFYAP23511 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NFYAP23511 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NFYAP23511 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NFYAP23511 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NFYAP23511 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NFYAP23511 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NFYAP23511 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NFYAP23511 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NFYAP23511 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NFYAP23511 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NFYAP23511 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NFYAP23511 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NFYAP23511 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NFYAP23511 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NFYAP23511 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NFYAP23511 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NFYAP23511 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NFYAP23511 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NFYAP23511 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NFYAP23511 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NFYAP23511 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NFYAP23511 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NFYAP23511 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NFYAP23511 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NFYAP23511 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NFYAP23511 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NFYAP23511 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NFYAP23511 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NFYAP23511 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NFYAP23511 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NFYAP23511 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NFYAP23511 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NFYAP23511 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NFYAP23511 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NFYAP23511 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NFYAP23511 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NFYAP23511 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NFYAP23511 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NFYAP23511 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NFYAP23511 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NFYAP23511 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NFYAP23511 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NFYAP23511 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NFYAP23511 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NFYAP23511 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NFYAP23511 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NFYAP23511 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NFYAP23511 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NFYAP23511 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NFYAP23511 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NFYAP23511 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NFYAP23511 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NFYAP23511 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NFYAP23511 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NFYAP23511 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NFYAP23511 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NFYAP23511 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NFYAP23511 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NFYAP23511 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NFYAP23511 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NFYAP23511 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NFYAP23511 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NFYAP23511 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NFYAP23511 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NFYAP23511 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NFYAP23511 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NFYAP23511 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NFYAP23511 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms