Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTPREP23469 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTPREP23469 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTPREP23469 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PTPREP23469 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTPREP23469 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTPREP23469 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTPREP23469 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTPREP23469 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTPREP23469 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTPREP23469 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTPREP23469 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTPREP23469 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTPREP23469 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTPREP23469 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PTPREP23469 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PTPREP23469 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PTPREP23469 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTPREP23469 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PTPREP23469 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
PTPREP23469 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTPREP23469 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PTPREP23469 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PTPREP23469 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTPREP23469 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PTPREP23469 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTPREP23469 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTPREP23469 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PTPREP23469 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PTPREP23469 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTPREP23469 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTPREP23469 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PTPREP23469 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PTPREP23469 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPREP23469 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPREP23469 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPREP23469 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPREP23469 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPREP23469 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPREP23469 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPREP23469 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPREP23469 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPREP23469 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPREP23469 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPREP23469 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPREP23469 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPREP23469 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPREP23469 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPREP23469 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPREP23469 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPREP23469 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPREP23469 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPREP23469 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPREP23469 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPREP23469 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPREP23469 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPREP23469 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPREP23469 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPREP23469 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPREP23469 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPREP23469 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPREP23469 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPREP23469 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPREP23469 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPREP23469 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPREP23469 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PTPREP23469 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPREP23469 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPREP23469 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPREP23469 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPREP23469 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPREP23469 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPREP23469 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPREP23469 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPREP23469 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPREP23469 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPREP23469 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPREP23469 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPREP23469 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPREP23469 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPREP23469 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPREP23469 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPREP23469 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPREP23469 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPREP23469 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPREP23469 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPREP23469 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPREP23469 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPREP23469 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPREP23469 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPREP23469 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPREP23469 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPREP23469 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPREP23469 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PTPREP23469 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPREP23469 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPREP23469 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPREP23469 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPREP23469 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PTPREP23469 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
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