Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HRCP23327 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HRCP23327 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HRCP23327 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HRCP23327 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HRCP23327 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HRCP23327 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HRCP23327 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HRCP23327 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HRCP23327 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HRCP23327 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HRCP23327 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HRCP23327 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HRCP23327 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HRCP23327 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HRCP23327 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HRCP23327 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HRCP23327 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HRCP23327 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HRCP23327 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HRCP23327 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HRCP23327 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HRCP23327 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HRCP23327 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HRCP23327 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
HRCP23327 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
HRCP23327 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
HRCP23327 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HRCP23327 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HRCP23327 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
HRCP23327 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
HRCP23327 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HRCP23327 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
HRCP23327 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
HRCP23327 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HRCP23327 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
HRCP23327 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HRCP23327 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HRCP23327 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
HRCP23327 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HRCP23327 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HRCP23327 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HRCP23327 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HRCP23327 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HRCP23327 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HRCP23327 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HRCP23327 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HRCP23327 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HRCP23327 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HRCP23327 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HRCP23327 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HRCP23327 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HRCP23327 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HRCP23327 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HRCP23327 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HRCP23327 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HRCP23327 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HRCP23327 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HRCP23327 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HRCP23327 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HRCP23327 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
HRCP23327 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HRCP23327 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HRCP23327 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HRCP23327 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HRCP23327 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HRCP23327 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HRCP23327 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HRCP23327 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HRCP23327 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HRCP23327 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HRCP23327 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HRCP23327 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HRCP23327 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HRCP23327 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
HRCP23327 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
HRCP23327 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
HRCP23327 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
HRCP23327 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
HRCP23327 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
HRCP23327 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
HRCP23327 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
HRCP23327 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
HRCP23327 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
HRCP23327 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
HRCP23327 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
HRCP23327 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
HRCP23327 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
HRCP23327 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
HRCP23327 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
HRCP23327 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
HRCP23327 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
HRCP23327 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HRCP23327 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HRCP23327 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HRCP23327 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
HRCP23327 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
HRCP23327 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
HRCP23327 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
HRCP23327 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms