Protein–RNA interactions for Protein: P20851

C4BPB, C4b-binding protein beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BPBP20851 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C4BPBP20851 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C4BPBP20851 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
C4BPBP20851 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C4BPBP20851 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms