Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
GJB1P08034 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GJB1P08034 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GJB1P08034 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GJB1P08034 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GJB1P08034 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GJB1P08034 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GJB1P08034 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GJB1P08034 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GJB1P08034 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GJB1P08034 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GJB1P08034 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GJB1P08034 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GJB1P08034 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GJB1P08034 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GJB1P08034 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GJB1P08034 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GJB1P08034 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GJB1P08034 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GJB1P08034 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GJB1P08034 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GJB1P08034 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GJB1P08034 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GJB1P08034 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GJB1P08034 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GJB1P08034 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GJB1P08034 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GJB1P08034 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GJB1P08034 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
GJB1P08034 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GJB1P08034 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GJB1P08034 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
GJB1P08034 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GJB1P08034 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GJB1P08034 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GJB1P08034 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GJB1P08034 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GJB1P08034 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
GJB1P08034 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
GJB1P08034 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
GJB1P08034 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
GJB1P08034 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
GJB1P08034 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
GJB1P08034 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GJB1P08034 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GJB1P08034 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GJB1P08034 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GJB1P08034 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GJB1P08034 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GJB1P08034 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GJB1P08034 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GJB1P08034 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GJB1P08034 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GJB1P08034 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GJB1P08034 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GJB1P08034 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GJB1P08034 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GJB1P08034 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GJB1P08034 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GJB1P08034 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GJB1P08034 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GJB1P08034 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
GJB1P08034 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GJB1P08034 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GJB1P08034 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GJB1P08034 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GJB1P08034 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GJB1P08034 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GJB1P08034 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GJB1P08034 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GJB1P08034 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
GJB1P08034 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GJB1P08034 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GJB1P08034 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GJB1P08034 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GJB1P08034 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GJB1P08034 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GJB1P08034 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GJB1P08034 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GJB1P08034 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GJB1P08034 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GJB1P08034 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GJB1P08034 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GJB1P08034 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GJB1P08034 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GJB1P08034 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GJB1P08034 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GJB1P08034 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GJB1P08034 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GJB1P08034 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GJB1P08034 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GJB1P08034 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GJB1P08034 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GJB1P08034 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GJB1P08034 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GJB1P08034 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GJB1P08034 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GJB1P08034 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GJB1P08034 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GJB1P08034 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms