Protein–RNA interactions for Protein: O96018

APBA3, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA3O96018 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
APBA3O96018 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
APBA3O96018 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
APBA3O96018 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
APBA3O96018 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
APBA3O96018 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
APBA3O96018 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
APBA3O96018 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
APBA3O96018 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
APBA3O96018 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
APBA3O96018 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
APBA3O96018 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
APBA3O96018 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
APBA3O96018 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
APBA3O96018 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
APBA3O96018 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
APBA3O96018 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
APBA3O96018 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
APBA3O96018 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
APBA3O96018 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
APBA3O96018 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
APBA3O96018 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
APBA3O96018 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
APBA3O96018 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
APBA3O96018 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
APBA3O96018 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
APBA3O96018 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
APBA3O96018 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
APBA3O96018 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
APBA3O96018 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
APBA3O96018 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
APBA3O96018 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
APBA3O96018 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
APBA3O96018 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
APBA3O96018 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
APBA3O96018 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
APBA3O96018 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
APBA3O96018 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
APBA3O96018 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
APBA3O96018 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
APBA3O96018 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
APBA3O96018 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
APBA3O96018 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
APBA3O96018 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
APBA3O96018 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
APBA3O96018 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
APBA3O96018 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
APBA3O96018 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
APBA3O96018 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
APBA3O96018 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
APBA3O96018 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
APBA3O96018 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
APBA3O96018 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
APBA3O96018 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
APBA3O96018 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
APBA3O96018 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
APBA3O96018 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
APBA3O96018 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APBA3O96018 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APBA3O96018 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APBA3O96018 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APBA3O96018 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APBA3O96018 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
APBA3O96018 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APBA3O96018 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APBA3O96018 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
APBA3O96018 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
APBA3O96018 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APBA3O96018 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APBA3O96018 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APBA3O96018 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APBA3O96018 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
APBA3O96018 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
APBA3O96018 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
APBA3O96018 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
APBA3O96018 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APBA3O96018 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APBA3O96018 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APBA3O96018 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
APBA3O96018 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APBA3O96018 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
APBA3O96018 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
APBA3O96018 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APBA3O96018 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
APBA3O96018 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
APBA3O96018 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APBA3O96018 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APBA3O96018 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
APBA3O96018 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APBA3O96018 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APBA3O96018 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APBA3O96018 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APBA3O96018 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APBA3O96018 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APBA3O96018 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APBA3O96018 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
APBA3O96018 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APBA3O96018 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
APBA3O96018 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
APBA3O96018 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms