Protein–RNA interactions for Protein: O95931

CBX7, Chromobox protein homolog 7, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX7O95931 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CBX7O95931 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CBX7O95931 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CBX7O95931 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CBX7O95931 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CBX7O95931 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CBX7O95931 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CBX7O95931 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CBX7O95931 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CBX7O95931 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CBX7O95931 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CBX7O95931 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CBX7O95931 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CBX7O95931 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CBX7O95931 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CBX7O95931 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CBX7O95931 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CBX7O95931 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CBX7O95931 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CBX7O95931 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CBX7O95931 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CBX7O95931 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CBX7O95931 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CBX7O95931 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CBX7O95931 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CBX7O95931 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CBX7O95931 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CBX7O95931 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CBX7O95931 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CBX7O95931 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CBX7O95931 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CBX7O95931 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CBX7O95931 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CBX7O95931 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CBX7O95931 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CBX7O95931 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CBX7O95931 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CBX7O95931 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CBX7O95931 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CBX7O95931 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CBX7O95931 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CBX7O95931 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CBX7O95931 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CBX7O95931 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CBX7O95931 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CBX7O95931 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CBX7O95931 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CBX7O95931 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CBX7O95931 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CBX7O95931 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CBX7O95931 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CBX7O95931 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CBX7O95931 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CBX7O95931 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CBX7O95931 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CBX7O95931 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CBX7O95931 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CBX7O95931 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CBX7O95931 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CBX7O95931 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CBX7O95931 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CBX7O95931 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CBX7O95931 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CBX7O95931 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CBX7O95931 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CBX7O95931 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CBX7O95931 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CBX7O95931 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CBX7O95931 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CBX7O95931 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CBX7O95931 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CBX7O95931 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CBX7O95931 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CBX7O95931 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CBX7O95931 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CBX7O95931 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CBX7O95931 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CBX7O95931 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CBX7O95931 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CBX7O95931 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CBX7O95931 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CBX7O95931 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CBX7O95931 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CBX7O95931 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CBX7O95931 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CBX7O95931 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CBX7O95931 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CBX7O95931 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CBX7O95931 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CBX7O95931 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CBX7O95931 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CBX7O95931 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CBX7O95931 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CBX7O95931 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CBX7O95931 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CBX7O95931 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CBX7O95931 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CBX7O95931 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CBX7O95931 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CBX7O95931 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms