Protein–RNA interactions for Protein: O94817

ATG12, Ubiquitin-like protein ATG12, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG12O94817 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG12O94817 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG12O94817 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG12O94817 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG12O94817 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG12O94817 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG12O94817 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG12O94817 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG12O94817 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG12O94817 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG12O94817 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG12O94817 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG12O94817 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG12O94817 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG12O94817 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG12O94817 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG12O94817 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG12O94817 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG12O94817 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG12O94817 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG12O94817 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG12O94817 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG12O94817 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG12O94817 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG12O94817 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG12O94817 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG12O94817 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG12O94817 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG12O94817 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG12O94817 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG12O94817 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG12O94817 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG12O94817 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG12O94817 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG12O94817 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG12O94817 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG12O94817 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG12O94817 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG12O94817 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG12O94817 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG12O94817 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG12O94817 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG12O94817 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG12O94817 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG12O94817 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG12O94817 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG12O94817 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG12O94817 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG12O94817 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG12O94817 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG12O94817 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG12O94817 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG12O94817 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG12O94817 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG12O94817 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG12O94817 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG12O94817 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG12O94817 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG12O94817 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG12O94817 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG12O94817 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG12O94817 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG12O94817 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG12O94817 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG12O94817 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG12O94817 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG12O94817 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG12O94817 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG12O94817 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG12O94817 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG12O94817 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG12O94817 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG12O94817 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG12O94817 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG12O94817 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG12O94817 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG12O94817 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG12O94817 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG12O94817 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG12O94817 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG12O94817 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG12O94817 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG12O94817 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG12O94817 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG12O94817 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG12O94817 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG12O94817 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG12O94817 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG12O94817 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG12O94817 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG12O94817 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG12O94817 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG12O94817 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG12O94817 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG12O94817 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG12O94817 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG12O94817 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG12O94817 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG12O94817 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATG12O94817 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms