Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NIPSNAP2O75323 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms