Protein–RNA interactions for Protein: O60303

KIAA0556, Protein KIAA0556, humanhuman

Predictions only

Length 1,618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0556O60303 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
KIAA0556O60303 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
KIAA0556O60303 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KIAA0556O60303 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KIAA0556O60303 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
KIAA0556O60303 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
KIAA0556O60303 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KIAA0556O60303 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KIAA0556O60303 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
KIAA0556O60303 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KIAA0556O60303 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
KIAA0556O60303 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KIAA0556O60303 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KIAA0556O60303 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
KIAA0556O60303 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
KIAA0556O60303 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
KIAA0556O60303 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KIAA0556O60303 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
KIAA0556O60303 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KIAA0556O60303 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KIAA0556O60303 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KIAA0556O60303 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KIAA0556O60303 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
KIAA0556O60303 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KIAA0556O60303 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
KIAA0556O60303 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
KIAA0556O60303 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KIAA0556O60303 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
KIAA0556O60303 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KIAA0556O60303 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
KIAA0556O60303 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KIAA0556O60303 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
KIAA0556O60303 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KIAA0556O60303 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KIAA0556O60303 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
KIAA0556O60303 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KIAA0556O60303 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KIAA0556O60303 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KIAA0556O60303 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KIAA0556O60303 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
KIAA0556O60303 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KIAA0556O60303 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
KIAA0556O60303 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
KIAA0556O60303 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
KIAA0556O60303 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
KIAA0556O60303 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
KIAA0556O60303 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
KIAA0556O60303 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.1
KIAA0556O60303 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
KIAA0556O60303 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
KIAA0556O60303 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
KIAA0556O60303 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
KIAA0556O60303 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
KIAA0556O60303 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
KIAA0556O60303 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
KIAA0556O60303 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.09
KIAA0556O60303 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
KIAA0556O60303 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
KIAA0556O60303 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.09
KIAA0556O60303 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
KIAA0556O60303 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
KIAA0556O60303 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
KIAA0556O60303 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KIAA0556O60303 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KIAA0556O60303 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
KIAA0556O60303 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KIAA0556O60303 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
KIAA0556O60303 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KIAA0556O60303 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KIAA0556O60303 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
KIAA0556O60303 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
KIAA0556O60303 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
KIAA0556O60303 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
KIAA0556O60303 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
KIAA0556O60303 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KIAA0556O60303 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KIAA0556O60303 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
KIAA0556O60303 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
KIAA0556O60303 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
KIAA0556O60303 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KIAA0556O60303 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
KIAA0556O60303 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
KIAA0556O60303 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
KIAA0556O60303 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
KIAA0556O60303 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
KIAA0556O60303 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
KIAA0556O60303 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
KIAA0556O60303 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KIAA0556O60303 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KIAA0556O60303 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KIAA0556O60303 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
KIAA0556O60303 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
KIAA0556O60303 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KIAA0556O60303 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KIAA0556O60303 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KIAA0556O60303 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KIAA0556O60303 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KIAA0556O60303 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
KIAA0556O60303 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
KIAA0556O60303 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms