Protein–RNA interactions for Protein: O60296

TRAK2, Trafficking kinesin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK2O60296 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAK2O60296 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAK2O60296 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAK2O60296 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAK2O60296 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAK2O60296 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAK2O60296 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAK2O60296 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAK2O60296 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAK2O60296 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAK2O60296 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAK2O60296 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAK2O60296 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAK2O60296 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAK2O60296 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAK2O60296 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAK2O60296 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAK2O60296 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAK2O60296 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAK2O60296 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAK2O60296 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAK2O60296 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAK2O60296 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAK2O60296 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAK2O60296 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAK2O60296 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAK2O60296 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAK2O60296 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAK2O60296 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAK2O60296 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAK2O60296 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAK2O60296 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAK2O60296 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAK2O60296 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAK2O60296 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAK2O60296 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAK2O60296 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAK2O60296 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAK2O60296 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAK2O60296 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAK2O60296 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAK2O60296 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAK2O60296 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAK2O60296 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAK2O60296 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAK2O60296 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAK2O60296 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAK2O60296 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAK2O60296 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAK2O60296 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAK2O60296 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAK2O60296 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAK2O60296 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAK2O60296 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAK2O60296 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAK2O60296 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAK2O60296 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAK2O60296 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAK2O60296 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAK2O60296 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAK2O60296 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAK2O60296 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAK2O60296 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAK2O60296 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAK2O60296 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
TRAK2O60296 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAK2O60296 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAK2O60296 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAK2O60296 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAK2O60296 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAK2O60296 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAK2O60296 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAK2O60296 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAK2O60296 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAK2O60296 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAK2O60296 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAK2O60296 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAK2O60296 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAK2O60296 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAK2O60296 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAK2O60296 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAK2O60296 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAK2O60296 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAK2O60296 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAK2O60296 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAK2O60296 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAK2O60296 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAK2O60296 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAK2O60296 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAK2O60296 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAK2O60296 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAK2O60296 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAK2O60296 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAK2O60296 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAK2O60296 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAK2O60296 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAK2O60296 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAK2O60296 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAK2O60296 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAK2O60296 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms