Protein–RNA interactions for Protein: O43610

SPRY3, Protein sprouty homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRY3O43610 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPRY3O43610 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms