Protein–RNA interactions for Protein: O15056

SYNJ2, Synaptojanin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,496 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNJ2O15056 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SYNJ2O15056 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SYNJ2O15056 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SYNJ2O15056 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SYNJ2O15056 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SYNJ2O15056 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
SYNJ2O15056 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SYNJ2O15056 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SYNJ2O15056 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SYNJ2O15056 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
SYNJ2O15056 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SYNJ2O15056 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SYNJ2O15056 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
SYNJ2O15056 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SYNJ2O15056 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SYNJ2O15056 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SYNJ2O15056 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SYNJ2O15056 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SYNJ2O15056 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SYNJ2O15056 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
SYNJ2O15056 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SYNJ2O15056 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SYNJ2O15056 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
SYNJ2O15056 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SYNJ2O15056 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SYNJ2O15056 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SYNJ2O15056 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SYNJ2O15056 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SYNJ2O15056 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SYNJ2O15056 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SYNJ2O15056 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
SYNJ2O15056 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SYNJ2O15056 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
SYNJ2O15056 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
SYNJ2O15056 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SYNJ2O15056 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SYNJ2O15056 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SYNJ2O15056 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SYNJ2O15056 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SYNJ2O15056 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SYNJ2O15056 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
SYNJ2O15056 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SYNJ2O15056 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SYNJ2O15056 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SYNJ2O15056 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SYNJ2O15056 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
SYNJ2O15056 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SYNJ2O15056 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SYNJ2O15056 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SYNJ2O15056 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
SYNJ2O15056 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SYNJ2O15056 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
SYNJ2O15056 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
SYNJ2O15056 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SYNJ2O15056 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SYNJ2O15056 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SYNJ2O15056 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SYNJ2O15056 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SYNJ2O15056 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SYNJ2O15056 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SYNJ2O15056 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SYNJ2O15056 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SYNJ2O15056 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SYNJ2O15056 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SYNJ2O15056 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SYNJ2O15056 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SYNJ2O15056 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SYNJ2O15056 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
SYNJ2O15056 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SYNJ2O15056 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SYNJ2O15056 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
SYNJ2O15056 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
SYNJ2O15056 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SYNJ2O15056 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SYNJ2O15056 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SYNJ2O15056 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SYNJ2O15056 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SYNJ2O15056 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SYNJ2O15056 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SYNJ2O15056 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SYNJ2O15056 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
SYNJ2O15056 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SYNJ2O15056 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SYNJ2O15056 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SYNJ2O15056 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SYNJ2O15056 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SYNJ2O15056 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SYNJ2O15056 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
SYNJ2O15056 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SYNJ2O15056 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SYNJ2O15056 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SYNJ2O15056 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SYNJ2O15056 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SYNJ2O15056 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SYNJ2O15056 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SYNJ2O15056 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SYNJ2O15056 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SYNJ2O15056 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SYNJ2O15056 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SYNJ2O15056 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms