Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
APOC4-APOC2K7ER74 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
APOC4-APOC2K7ER74 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.3 ms