Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PATL2C9JE40 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PATL2C9JE40 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PATL2C9JE40 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PATL2C9JE40 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PATL2C9JE40 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PATL2C9JE40 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PATL2C9JE40 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PATL2C9JE40 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PATL2C9JE40 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PATL2C9JE40 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PATL2C9JE40 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PATL2C9JE40 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PATL2C9JE40 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PATL2C9JE40 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PATL2C9JE40 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PATL2C9JE40 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PATL2C9JE40 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PATL2C9JE40 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PATL2C9JE40 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PATL2C9JE40 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PATL2C9JE40 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PATL2C9JE40 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PATL2C9JE40 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PATL2C9JE40 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PATL2C9JE40 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PATL2C9JE40 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PATL2C9JE40 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PATL2C9JE40 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PATL2C9JE40 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PATL2C9JE40 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PATL2C9JE40 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PATL2C9JE40 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PATL2C9JE40 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PATL2C9JE40 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PATL2C9JE40 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PATL2C9JE40 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PATL2C9JE40 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PATL2C9JE40 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PATL2C9JE40 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PATL2C9JE40 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PATL2C9JE40 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PATL2C9JE40 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PATL2C9JE40 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PATL2C9JE40 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PATL2C9JE40 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PATL2C9JE40 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PATL2C9JE40 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PATL2C9JE40 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PATL2C9JE40 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PATL2C9JE40 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PATL2C9JE40 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PATL2C9JE40 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PATL2C9JE40 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PATL2C9JE40 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PATL2C9JE40 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PATL2C9JE40 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PATL2C9JE40 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PATL2C9JE40 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PATL2C9JE40 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PATL2C9JE40 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PATL2C9JE40 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PATL2C9JE40 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PATL2C9JE40 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PATL2C9JE40 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PATL2C9JE40 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
PATL2C9JE40 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PATL2C9JE40 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms