Protein–RNA interactions for Protein: A4D1E1

ZNF804B, Zinc finger protein 804B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF804BA4D1E1 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF804BA4D1E1 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF804BA4D1E1 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF804BA4D1E1 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF804BA4D1E1 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF804BA4D1E1 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF804BA4D1E1 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF804BA4D1E1 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF804BA4D1E1 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF804BA4D1E1 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF804BA4D1E1 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF804BA4D1E1 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF804BA4D1E1 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF804BA4D1E1 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF804BA4D1E1 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF804BA4D1E1 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF804BA4D1E1 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF804BA4D1E1 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF804BA4D1E1 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF804BA4D1E1 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF804BA4D1E1 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF804BA4D1E1 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF804BA4D1E1 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF804BA4D1E1 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF804BA4D1E1 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF804BA4D1E1 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF804BA4D1E1 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF804BA4D1E1 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF804BA4D1E1 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF804BA4D1E1 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF804BA4D1E1 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF804BA4D1E1 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF804BA4D1E1 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF804BA4D1E1 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF804BA4D1E1 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF804BA4D1E1 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF804BA4D1E1 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF804BA4D1E1 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF804BA4D1E1 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF804BA4D1E1 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF804BA4D1E1 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF804BA4D1E1 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF804BA4D1E1 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF804BA4D1E1 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF804BA4D1E1 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF804BA4D1E1 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF804BA4D1E1 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF804BA4D1E1 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF804BA4D1E1 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF804BA4D1E1 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF804BA4D1E1 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF804BA4D1E1 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF804BA4D1E1 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF804BA4D1E1 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF804BA4D1E1 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF804BA4D1E1 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF804BA4D1E1 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF804BA4D1E1 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF804BA4D1E1 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF804BA4D1E1 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF804BA4D1E1 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF804BA4D1E1 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF804BA4D1E1 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF804BA4D1E1 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF804BA4D1E1 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF804BA4D1E1 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF804BA4D1E1 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF804BA4D1E1 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF804BA4D1E1 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF804BA4D1E1 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF804BA4D1E1 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF804BA4D1E1 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF804BA4D1E1 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF804BA4D1E1 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF804BA4D1E1 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF804BA4D1E1 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF804BA4D1E1 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF804BA4D1E1 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF804BA4D1E1 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF804BA4D1E1 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF804BA4D1E1 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF804BA4D1E1 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF804BA4D1E1 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF804BA4D1E1 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF804BA4D1E1 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF804BA4D1E1 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF804BA4D1E1 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF804BA4D1E1 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF804BA4D1E1 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF804BA4D1E1 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF804BA4D1E1 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF804BA4D1E1 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF804BA4D1E1 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF804BA4D1E1 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF804BA4D1E1 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF804BA4D1E1 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF804BA4D1E1 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF804BA4D1E1 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF804BA4D1E1 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF804BA4D1E1 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms