Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C0

NRXN3, Neurexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN3Q9Y4C0 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NRXN3Q9Y4C0 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NRXN3Q9Y4C0 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NRXN3Q9Y4C0 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NRXN3Q9Y4C0 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NRXN3Q9Y4C0 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NRXN3Q9Y4C0 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NRXN3Q9Y4C0 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
NRXN3Q9Y4C0 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NRXN3Q9Y4C0 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NRXN3Q9Y4C0 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NRXN3Q9Y4C0 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NRXN3Q9Y4C0 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NRXN3Q9Y4C0 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NRXN3Q9Y4C0 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NRXN3Q9Y4C0 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NRXN3Q9Y4C0 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NRXN3Q9Y4C0 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NRXN3Q9Y4C0 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NRXN3Q9Y4C0 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NRXN3Q9Y4C0 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NRXN3Q9Y4C0 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
NRXN3Q9Y4C0 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NRXN3Q9Y4C0 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NRXN3Q9Y4C0 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NRXN3Q9Y4C0 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NRXN3Q9Y4C0 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NRXN3Q9Y4C0 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NRXN3Q9Y4C0 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NRXN3Q9Y4C0 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NRXN3Q9Y4C0 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NRXN3Q9Y4C0 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
NRXN3Q9Y4C0 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NRXN3Q9Y4C0 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NRXN3Q9Y4C0 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NRXN3Q9Y4C0 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NRXN3Q9Y4C0 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NRXN3Q9Y4C0 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NRXN3Q9Y4C0 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NRXN3Q9Y4C0 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NRXN3Q9Y4C0 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
NRXN3Q9Y4C0 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NRXN3Q9Y4C0 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
NRXN3Q9Y4C0 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
NRXN3Q9Y4C0 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
NRXN3Q9Y4C0 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
NRXN3Q9Y4C0 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
NRXN3Q9Y4C0 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
NRXN3Q9Y4C0 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
NRXN3Q9Y4C0 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
NRXN3Q9Y4C0 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
NRXN3Q9Y4C0 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
NRXN3Q9Y4C0 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
NRXN3Q9Y4C0 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
NRXN3Q9Y4C0 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
NRXN3Q9Y4C0 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
NRXN3Q9Y4C0 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NRXN3Q9Y4C0 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NRXN3Q9Y4C0 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NRXN3Q9Y4C0 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NRXN3Q9Y4C0 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NRXN3Q9Y4C0 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NRXN3Q9Y4C0 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NRXN3Q9Y4C0 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NRXN3Q9Y4C0 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NRXN3Q9Y4C0 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NRXN3Q9Y4C0 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NRXN3Q9Y4C0 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
NRXN3Q9Y4C0 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NRXN3Q9Y4C0 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NRXN3Q9Y4C0 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NRXN3Q9Y4C0 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NRXN3Q9Y4C0 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NRXN3Q9Y4C0 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NRXN3Q9Y4C0 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NRXN3Q9Y4C0 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NRXN3Q9Y4C0 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NRXN3Q9Y4C0 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NRXN3Q9Y4C0 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NRXN3Q9Y4C0 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NRXN3Q9Y4C0 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NRXN3Q9Y4C0 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NRXN3Q9Y4C0 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NRXN3Q9Y4C0 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
NRXN3Q9Y4C0 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NRXN3Q9Y4C0 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NRXN3Q9Y4C0 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NRXN3Q9Y4C0 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NRXN3Q9Y4C0 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NRXN3Q9Y4C0 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NRXN3Q9Y4C0 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NRXN3Q9Y4C0 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NRXN3Q9Y4C0 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NRXN3Q9Y4C0 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NRXN3Q9Y4C0 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NRXN3Q9Y4C0 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NRXN3Q9Y4C0 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NRXN3Q9Y4C0 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
NRXN3Q9Y4C0 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NRXN3Q9Y4C0 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms