Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W1

THRAP3, Thyroid hormone receptor-associated protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THRAP3Q9Y2W1 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
THRAP3Q9Y2W1 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
THRAP3Q9Y2W1 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
THRAP3Q9Y2W1 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
THRAP3Q9Y2W1 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
THRAP3Q9Y2W1 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
THRAP3Q9Y2W1 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
THRAP3Q9Y2W1 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
THRAP3Q9Y2W1 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
THRAP3Q9Y2W1 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
THRAP3Q9Y2W1 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
THRAP3Q9Y2W1 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
THRAP3Q9Y2W1 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
THRAP3Q9Y2W1 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
THRAP3Q9Y2W1 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
THRAP3Q9Y2W1 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
THRAP3Q9Y2W1 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
THRAP3Q9Y2W1 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
THRAP3Q9Y2W1 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
THRAP3Q9Y2W1 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
THRAP3Q9Y2W1 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
THRAP3Q9Y2W1 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
THRAP3Q9Y2W1 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
THRAP3Q9Y2W1 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
THRAP3Q9Y2W1 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
THRAP3Q9Y2W1 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
THRAP3Q9Y2W1 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
THRAP3Q9Y2W1 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
THRAP3Q9Y2W1 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
THRAP3Q9Y2W1 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
THRAP3Q9Y2W1 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
THRAP3Q9Y2W1 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
THRAP3Q9Y2W1 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
THRAP3Q9Y2W1 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
THRAP3Q9Y2W1 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
THRAP3Q9Y2W1 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
THRAP3Q9Y2W1 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
THRAP3Q9Y2W1 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
THRAP3Q9Y2W1 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
THRAP3Q9Y2W1 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
THRAP3Q9Y2W1 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
THRAP3Q9Y2W1 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
THRAP3Q9Y2W1 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
THRAP3Q9Y2W1 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
THRAP3Q9Y2W1 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
THRAP3Q9Y2W1 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
THRAP3Q9Y2W1 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
THRAP3Q9Y2W1 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
THRAP3Q9Y2W1 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
THRAP3Q9Y2W1 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
THRAP3Q9Y2W1 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
THRAP3Q9Y2W1 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
THRAP3Q9Y2W1 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
THRAP3Q9Y2W1 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
THRAP3Q9Y2W1 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
THRAP3Q9Y2W1 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
THRAP3Q9Y2W1 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
THRAP3Q9Y2W1 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
THRAP3Q9Y2W1 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
THRAP3Q9Y2W1 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
THRAP3Q9Y2W1 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
THRAP3Q9Y2W1 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
THRAP3Q9Y2W1 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
THRAP3Q9Y2W1 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
THRAP3Q9Y2W1 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
THRAP3Q9Y2W1 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
THRAP3Q9Y2W1 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
THRAP3Q9Y2W1 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
THRAP3Q9Y2W1 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
THRAP3Q9Y2W1 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
THRAP3Q9Y2W1 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
THRAP3Q9Y2W1 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
THRAP3Q9Y2W1 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
THRAP3Q9Y2W1 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
THRAP3Q9Y2W1 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
THRAP3Q9Y2W1 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
THRAP3Q9Y2W1 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
THRAP3Q9Y2W1 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
THRAP3Q9Y2W1 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
THRAP3Q9Y2W1 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
THRAP3Q9Y2W1 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
THRAP3Q9Y2W1 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
THRAP3Q9Y2W1 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
THRAP3Q9Y2W1 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
THRAP3Q9Y2W1 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
THRAP3Q9Y2W1 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
THRAP3Q9Y2W1 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
THRAP3Q9Y2W1 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
THRAP3Q9Y2W1 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
THRAP3Q9Y2W1 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
THRAP3Q9Y2W1 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
THRAP3Q9Y2W1 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
THRAP3Q9Y2W1 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
THRAP3Q9Y2W1 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
THRAP3Q9Y2W1 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
THRAP3Q9Y2W1 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
THRAP3Q9Y2W1 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
THRAP3Q9Y2W1 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
THRAP3Q9Y2W1 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
THRAP3Q9Y2W1 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms