Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQP3

TNN, Tenascin-N, humanhuman

Predictions only

Length 1,299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNQ9UQP3 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNNQ9UQP3 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNNQ9UQP3 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNNQ9UQP3 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNNQ9UQP3 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNNQ9UQP3 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNNQ9UQP3 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNNQ9UQP3 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNNQ9UQP3 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNNQ9UQP3 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNNQ9UQP3 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNNQ9UQP3 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNNQ9UQP3 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNNQ9UQP3 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNNQ9UQP3 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TNNQ9UQP3 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TNNQ9UQP3 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TNNQ9UQP3 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TNNQ9UQP3 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TNNQ9UQP3 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TNNQ9UQP3 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TNNQ9UQP3 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TNNQ9UQP3 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TNNQ9UQP3 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNNQ9UQP3 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNNQ9UQP3 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNNQ9UQP3 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TNNQ9UQP3 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNNQ9UQP3 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNNQ9UQP3 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNNQ9UQP3 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNNQ9UQP3 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNNQ9UQP3 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNNQ9UQP3 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNNQ9UQP3 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNNQ9UQP3 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNNQ9UQP3 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNNQ9UQP3 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNNQ9UQP3 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNNQ9UQP3 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNNQ9UQP3 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNNQ9UQP3 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNNQ9UQP3 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNNQ9UQP3 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNNQ9UQP3 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNNQ9UQP3 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNNQ9UQP3 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNNQ9UQP3 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TNNQ9UQP3 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TNNQ9UQP3 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNNQ9UQP3 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TNNQ9UQP3 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNNQ9UQP3 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNNQ9UQP3 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNNQ9UQP3 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNNQ9UQP3 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNNQ9UQP3 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNNQ9UQP3 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TNNQ9UQP3 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNNQ9UQP3 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNNQ9UQP3 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNNQ9UQP3 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNNQ9UQP3 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNNQ9UQP3 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNNQ9UQP3 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNNQ9UQP3 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNNQ9UQP3 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNNQ9UQP3 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNNQ9UQP3 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNNQ9UQP3 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNNQ9UQP3 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNNQ9UQP3 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNNQ9UQP3 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TNNQ9UQP3 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNNQ9UQP3 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNNQ9UQP3 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNNQ9UQP3 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNNQ9UQP3 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNNQ9UQP3 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNNQ9UQP3 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNNQ9UQP3 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNNQ9UQP3 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNNQ9UQP3 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNNQ9UQP3 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNNQ9UQP3 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNNQ9UQP3 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNNQ9UQP3 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNNQ9UQP3 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNNQ9UQP3 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNNQ9UQP3 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNNQ9UQP3 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNNQ9UQP3 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNNQ9UQP3 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNNQ9UQP3 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNNQ9UQP3 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNNQ9UQP3 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNNQ9UQP3 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNNQ9UQP3 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNNQ9UQP3 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TNNQ9UQP3 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms