Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVW-1Q9UQF0 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms