Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK4

MED23, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 23, humanhuman

Predictions only

Length 1,368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED23Q9ULK4 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MED23Q9ULK4 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MED23Q9ULK4 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MED23Q9ULK4 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MED23Q9ULK4 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MED23Q9ULK4 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MED23Q9ULK4 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MED23Q9ULK4 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MED23Q9ULK4 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MED23Q9ULK4 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MED23Q9ULK4 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MED23Q9ULK4 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MED23Q9ULK4 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MED23Q9ULK4 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MED23Q9ULK4 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MED23Q9ULK4 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MED23Q9ULK4 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MED23Q9ULK4 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MED23Q9ULK4 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MED23Q9ULK4 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MED23Q9ULK4 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MED23Q9ULK4 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MED23Q9ULK4 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MED23Q9ULK4 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MED23Q9ULK4 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MED23Q9ULK4 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MED23Q9ULK4 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MED23Q9ULK4 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MED23Q9ULK4 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MED23Q9ULK4 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MED23Q9ULK4 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MED23Q9ULK4 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MED23Q9ULK4 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MED23Q9ULK4 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MED23Q9ULK4 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MED23Q9ULK4 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MED23Q9ULK4 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MED23Q9ULK4 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MED23Q9ULK4 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MED23Q9ULK4 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MED23Q9ULK4 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MED23Q9ULK4 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MED23Q9ULK4 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MED23Q9ULK4 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MED23Q9ULK4 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MED23Q9ULK4 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MED23Q9ULK4 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MED23Q9ULK4 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MED23Q9ULK4 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MED23Q9ULK4 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MED23Q9ULK4 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MED23Q9ULK4 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MED23Q9ULK4 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MED23Q9ULK4 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MED23Q9ULK4 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MED23Q9ULK4 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MED23Q9ULK4 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MED23Q9ULK4 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MED23Q9ULK4 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MED23Q9ULK4 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MED23Q9ULK4 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MED23Q9ULK4 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MED23Q9ULK4 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MED23Q9ULK4 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MED23Q9ULK4 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MED23Q9ULK4 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MED23Q9ULK4 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MED23Q9ULK4 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MED23Q9ULK4 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MED23Q9ULK4 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MED23Q9ULK4 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MED23Q9ULK4 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MED23Q9ULK4 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MED23Q9ULK4 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MED23Q9ULK4 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MED23Q9ULK4 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MED23Q9ULK4 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MED23Q9ULK4 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MED23Q9ULK4 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MED23Q9ULK4 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MED23Q9ULK4 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MED23Q9ULK4 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MED23Q9ULK4 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MED23Q9ULK4 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MED23Q9ULK4 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MED23Q9ULK4 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MED23Q9ULK4 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MED23Q9ULK4 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MED23Q9ULK4 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MED23Q9ULK4 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MED23Q9ULK4 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MED23Q9ULK4 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MED23Q9ULK4 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MED23Q9ULK4 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MED23Q9ULK4 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MED23Q9ULK4 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MED23Q9ULK4 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MED23Q9ULK4 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MED23Q9ULK4 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MED23Q9ULK4 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms