Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULG1

INO80, DNA helicase INO80, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80Q9ULG1 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
INO80Q9ULG1 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
INO80Q9ULG1 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
INO80Q9ULG1 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
INO80Q9ULG1 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
INO80Q9ULG1 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
INO80Q9ULG1 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
INO80Q9ULG1 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
INO80Q9ULG1 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
INO80Q9ULG1 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
INO80Q9ULG1 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
INO80Q9ULG1 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
INO80Q9ULG1 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
INO80Q9ULG1 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
INO80Q9ULG1 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
INO80Q9ULG1 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
INO80Q9ULG1 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
INO80Q9ULG1 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
INO80Q9ULG1 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
INO80Q9ULG1 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
INO80Q9ULG1 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
INO80Q9ULG1 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
INO80Q9ULG1 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
INO80Q9ULG1 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
INO80Q9ULG1 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
INO80Q9ULG1 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
INO80Q9ULG1 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
INO80Q9ULG1 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
INO80Q9ULG1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
INO80Q9ULG1 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
INO80Q9ULG1 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
INO80Q9ULG1 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
INO80Q9ULG1 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
INO80Q9ULG1 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
INO80Q9ULG1 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
INO80Q9ULG1 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
INO80Q9ULG1 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
INO80Q9ULG1 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
INO80Q9ULG1 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
INO80Q9ULG1 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
INO80Q9ULG1 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
INO80Q9ULG1 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
INO80Q9ULG1 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
INO80Q9ULG1 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
INO80Q9ULG1 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
INO80Q9ULG1 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
INO80Q9ULG1 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
INO80Q9ULG1 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
INO80Q9ULG1 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
INO80Q9ULG1 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
INO80Q9ULG1 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
INO80Q9ULG1 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
INO80Q9ULG1 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
INO80Q9ULG1 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
INO80Q9ULG1 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
INO80Q9ULG1 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
INO80Q9ULG1 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
INO80Q9ULG1 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
INO80Q9ULG1 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
INO80Q9ULG1 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
INO80Q9ULG1 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
INO80Q9ULG1 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
INO80Q9ULG1 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
INO80Q9ULG1 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
INO80Q9ULG1 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
INO80Q9ULG1 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
INO80Q9ULG1 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
INO80Q9ULG1 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
INO80Q9ULG1 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
INO80Q9ULG1 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
INO80Q9ULG1 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
INO80Q9ULG1 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
INO80Q9ULG1 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
INO80Q9ULG1 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
INO80Q9ULG1 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
INO80Q9ULG1 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
INO80Q9ULG1 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
INO80Q9ULG1 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
INO80Q9ULG1 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
INO80Q9ULG1 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
INO80Q9ULG1 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
INO80Q9ULG1 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
INO80Q9ULG1 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
INO80Q9ULG1 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
INO80Q9ULG1 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
INO80Q9ULG1 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
INO80Q9ULG1 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
INO80Q9ULG1 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
INO80Q9ULG1 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
INO80Q9ULG1 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
INO80Q9ULG1 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
INO80Q9ULG1 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
INO80Q9ULG1 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
INO80Q9ULG1 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
INO80Q9ULG1 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
INO80Q9ULG1 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
INO80Q9ULG1 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
INO80Q9ULG1 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
INO80Q9ULG1 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
INO80Q9ULG1 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms