Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD9

ZNF608, Zinc finger protein 608, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF608Q9ULD9 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
ZNF608Q9ULD9 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ZNF608Q9ULD9 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ZNF608Q9ULD9 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
ZNF608Q9ULD9 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ZNF608Q9ULD9 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ZNF608Q9ULD9 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ZNF608Q9ULD9 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ZNF608Q9ULD9 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ZNF608Q9ULD9 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ZNF608Q9ULD9 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ZNF608Q9ULD9 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ZNF608Q9ULD9 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
ZNF608Q9ULD9 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ZNF608Q9ULD9 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ZNF608Q9ULD9 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ZNF608Q9ULD9 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ZNF608Q9ULD9 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ZNF608Q9ULD9 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ZNF608Q9ULD9 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ZNF608Q9ULD9 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ZNF608Q9ULD9 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ZNF608Q9ULD9 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ZNF608Q9ULD9 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ZNF608Q9ULD9 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ZNF608Q9ULD9 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ZNF608Q9ULD9 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ZNF608Q9ULD9 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ZNF608Q9ULD9 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ZNF608Q9ULD9 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ZNF608Q9ULD9 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ZNF608Q9ULD9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ZNF608Q9ULD9 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ZNF608Q9ULD9 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ZNF608Q9ULD9 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ZNF608Q9ULD9 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ZNF608Q9ULD9 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ZNF608Q9ULD9 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ZNF608Q9ULD9 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ZNF608Q9ULD9 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
ZNF608Q9ULD9 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ZNF608Q9ULD9 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
ZNF608Q9ULD9 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ZNF608Q9ULD9 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ZNF608Q9ULD9 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ZNF608Q9ULD9 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ZNF608Q9ULD9 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ZNF608Q9ULD9 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ZNF608Q9ULD9 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
ZNF608Q9ULD9 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ZNF608Q9ULD9 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ZNF608Q9ULD9 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ZNF608Q9ULD9 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ZNF608Q9ULD9 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.32
ZNF608Q9ULD9 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
ZNF608Q9ULD9 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC29.51■■■□□ 2.32
ZNF608Q9ULD9 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
ZNF608Q9ULD9 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC29.51■■■□□ 2.32
ZNF608Q9ULD9 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
ZNF608Q9ULD9 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
ZNF608Q9ULD9 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC29.51■■■□□ 2.32
ZNF608Q9ULD9 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
ZNF608Q9ULD9 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
ZNF608Q9ULD9 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ZNF608Q9ULD9 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ZNF608Q9ULD9 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ZNF608Q9ULD9 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ZNF608Q9ULD9 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ZNF608Q9ULD9 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ZNF608Q9ULD9 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ZNF608Q9ULD9 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ZNF608Q9ULD9 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ZNF608Q9ULD9 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ZNF608Q9ULD9 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
ZNF608Q9ULD9 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ZNF608Q9ULD9 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ZNF608Q9ULD9 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ZNF608Q9ULD9 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ZNF608Q9ULD9 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ZNF608Q9ULD9 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ZNF608Q9ULD9 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ZNF608Q9ULD9 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ZNF608Q9ULD9 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ZNF608Q9ULD9 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
ZNF608Q9ULD9 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ZNF608Q9ULD9 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ZNF608Q9ULD9 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ZNF608Q9ULD9 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ZNF608Q9ULD9 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ZNF608Q9ULD9 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ZNF608Q9ULD9 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ZNF608Q9ULD9 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ZNF608Q9ULD9 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ZNF608Q9ULD9 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ZNF608Q9ULD9 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ZNF608Q9ULD9 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
ZNF608Q9ULD9 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ZNF608Q9ULD9 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ZNF608Q9ULD9 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ZNF608Q9ULD9 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms