Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL3

CASP8AP2, CASP8-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,982 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP8AP2Q9UKL3 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CASP8AP2Q9UKL3 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CASP8AP2Q9UKL3 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CASP8AP2Q9UKL3 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CASP8AP2Q9UKL3 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CASP8AP2Q9UKL3 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CASP8AP2Q9UKL3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CASP8AP2Q9UKL3 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CASP8AP2Q9UKL3 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CASP8AP2Q9UKL3 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CASP8AP2Q9UKL3 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CASP8AP2Q9UKL3 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CASP8AP2Q9UKL3 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CASP8AP2Q9UKL3 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CASP8AP2Q9UKL3 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CASP8AP2Q9UKL3 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CASP8AP2Q9UKL3 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CASP8AP2Q9UKL3 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP8AP2Q9UKL3 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP8AP2Q9UKL3 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP8AP2Q9UKL3 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP8AP2Q9UKL3 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP8AP2Q9UKL3 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP8AP2Q9UKL3 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP8AP2Q9UKL3 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP8AP2Q9UKL3 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP8AP2Q9UKL3 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP8AP2Q9UKL3 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP8AP2Q9UKL3 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP8AP2Q9UKL3 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP8AP2Q9UKL3 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP8AP2Q9UKL3 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP8AP2Q9UKL3 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP8AP2Q9UKL3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP8AP2Q9UKL3 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP8AP2Q9UKL3 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP8AP2Q9UKL3 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP8AP2Q9UKL3 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASP8AP2Q9UKL3 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CASP8AP2Q9UKL3 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CASP8AP2Q9UKL3 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CASP8AP2Q9UKL3 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CASP8AP2Q9UKL3 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CASP8AP2Q9UKL3 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CASP8AP2Q9UKL3 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CASP8AP2Q9UKL3 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CASP8AP2Q9UKL3 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CASP8AP2Q9UKL3 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CASP8AP2Q9UKL3 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CASP8AP2Q9UKL3 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CASP8AP2Q9UKL3 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CASP8AP2Q9UKL3 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CASP8AP2Q9UKL3 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CASP8AP2Q9UKL3 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CASP8AP2Q9UKL3 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CASP8AP2Q9UKL3 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CASP8AP2Q9UKL3 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CASP8AP2Q9UKL3 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CASP8AP2Q9UKL3 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CASP8AP2Q9UKL3 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CASP8AP2Q9UKL3 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CASP8AP2Q9UKL3 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CASP8AP2Q9UKL3 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASP8AP2Q9UKL3 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASP8AP2Q9UKL3 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASP8AP2Q9UKL3 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASP8AP2Q9UKL3 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CASP8AP2Q9UKL3 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASP8AP2Q9UKL3 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASP8AP2Q9UKL3 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASP8AP2Q9UKL3 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASP8AP2Q9UKL3 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CASP8AP2Q9UKL3 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASP8AP2Q9UKL3 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASP8AP2Q9UKL3 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASP8AP2Q9UKL3 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CASP8AP2Q9UKL3 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASP8AP2Q9UKL3 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASP8AP2Q9UKL3 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASP8AP2Q9UKL3 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASP8AP2Q9UKL3 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASP8AP2Q9UKL3 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASP8AP2Q9UKL3 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASP8AP2Q9UKL3 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASP8AP2Q9UKL3 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASP8AP2Q9UKL3 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CASP8AP2Q9UKL3 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASP8AP2Q9UKL3 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASP8AP2Q9UKL3 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CASP8AP2Q9UKL3 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CASP8AP2Q9UKL3 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CASP8AP2Q9UKL3 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CASP8AP2Q9UKL3 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CASP8AP2Q9UKL3 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CASP8AP2Q9UKL3 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CASP8AP2Q9UKL3 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CASP8AP2Q9UKL3 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CASP8AP2Q9UKL3 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CASP8AP2Q9UKL3 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CASP8AP2Q9UKL3 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms