Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MBD1Q9UIS9 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms