Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCN11AQ9UI33 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCN11AQ9UI33 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCN11AQ9UI33 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCN11AQ9UI33 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCN11AQ9UI33 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCN11AQ9UI33 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCN11AQ9UI33 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCN11AQ9UI33 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCN11AQ9UI33 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCN11AQ9UI33 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SCN11AQ9UI33 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCN11AQ9UI33 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCN11AQ9UI33 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCN11AQ9UI33 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCN11AQ9UI33 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SCN11AQ9UI33 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SCN11AQ9UI33 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCN11AQ9UI33 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCN11AQ9UI33 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCN11AQ9UI33 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCN11AQ9UI33 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCN11AQ9UI33 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCN11AQ9UI33 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCN11AQ9UI33 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SCN11AQ9UI33 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCN11AQ9UI33 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCN11AQ9UI33 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCN11AQ9UI33 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCN11AQ9UI33 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCN11AQ9UI33 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SCN11AQ9UI33 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.27
SCN11AQ9UI33 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCN11AQ9UI33 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCN11AQ9UI33 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCN11AQ9UI33 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SCN11AQ9UI33 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SCN11AQ9UI33 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCN11AQ9UI33 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCN11AQ9UI33 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCN11AQ9UI33 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCN11AQ9UI33 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCN11AQ9UI33 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCN11AQ9UI33 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCN11AQ9UI33 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCN11AQ9UI33 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCN11AQ9UI33 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCN11AQ9UI33 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCN11AQ9UI33 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCN11AQ9UI33 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCN11AQ9UI33 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCN11AQ9UI33 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCN11AQ9UI33 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCN11AQ9UI33 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCN11AQ9UI33 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCN11AQ9UI33 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCN11AQ9UI33 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SCN11AQ9UI33 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCN11AQ9UI33 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCN11AQ9UI33 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCN11AQ9UI33 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCN11AQ9UI33 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCN11AQ9UI33 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SCN11AQ9UI33 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SCN11AQ9UI33 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SCN11AQ9UI33 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SCN11AQ9UI33 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SCN11AQ9UI33 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SCN11AQ9UI33 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCN11AQ9UI33 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCN11AQ9UI33 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SCN11AQ9UI33 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCN11AQ9UI33 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCN11AQ9UI33 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCN11AQ9UI33 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCN11AQ9UI33 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCN11AQ9UI33 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCN11AQ9UI33 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCN11AQ9UI33 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCN11AQ9UI33 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SCN11AQ9UI33 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCN11AQ9UI33 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCN11AQ9UI33 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCN11AQ9UI33 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCN11AQ9UI33 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCN11AQ9UI33 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCN11AQ9UI33 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCN11AQ9UI33 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCN11AQ9UI33 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCN11AQ9UI33 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCN11AQ9UI33 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCN11AQ9UI33 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCN11AQ9UI33 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCN11AQ9UI33 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCN11AQ9UI33 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCN11AQ9UI33 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCN11AQ9UI33 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCN11AQ9UI33 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCN11AQ9UI33 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SCN11AQ9UI33 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms