Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
KDM5BQ9UGL1 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KDM5BQ9UGL1 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KDM5BQ9UGL1 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KDM5BQ9UGL1 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
KDM5BQ9UGL1 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KDM5BQ9UGL1 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KDM5BQ9UGL1 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KDM5BQ9UGL1 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KDM5BQ9UGL1 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KDM5BQ9UGL1 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
KDM5BQ9UGL1 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KDM5BQ9UGL1 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KDM5BQ9UGL1 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KDM5BQ9UGL1 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KDM5BQ9UGL1 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
KDM5BQ9UGL1 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KDM5BQ9UGL1 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KDM5BQ9UGL1 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KDM5BQ9UGL1 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KDM5BQ9UGL1 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KDM5BQ9UGL1 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KDM5BQ9UGL1 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KDM5BQ9UGL1 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KDM5BQ9UGL1 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KDM5BQ9UGL1 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KDM5BQ9UGL1 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KDM5BQ9UGL1 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
KDM5BQ9UGL1 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
KDM5BQ9UGL1 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
KDM5BQ9UGL1 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
KDM5BQ9UGL1 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
KDM5BQ9UGL1 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
KDM5BQ9UGL1 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
KDM5BQ9UGL1 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
KDM5BQ9UGL1 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
KDM5BQ9UGL1 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
KDM5BQ9UGL1 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
KDM5BQ9UGL1 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
KDM5BQ9UGL1 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
KDM5BQ9UGL1 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
KDM5BQ9UGL1 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
KDM5BQ9UGL1 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
KDM5BQ9UGL1 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
KDM5BQ9UGL1 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KDM5BQ9UGL1 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KDM5BQ9UGL1 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
KDM5BQ9UGL1 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KDM5BQ9UGL1 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KDM5BQ9UGL1 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KDM5BQ9UGL1 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KDM5BQ9UGL1 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KDM5BQ9UGL1 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KDM5BQ9UGL1 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KDM5BQ9UGL1 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KDM5BQ9UGL1 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KDM5BQ9UGL1 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KDM5BQ9UGL1 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KDM5BQ9UGL1 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KDM5BQ9UGL1 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KDM5BQ9UGL1 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KDM5BQ9UGL1 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KDM5BQ9UGL1 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KDM5BQ9UGL1 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KDM5BQ9UGL1 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KDM5BQ9UGL1 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KDM5BQ9UGL1 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KDM5BQ9UGL1 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KDM5BQ9UGL1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KDM5BQ9UGL1 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KDM5BQ9UGL1 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KDM5BQ9UGL1 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KDM5BQ9UGL1 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
KDM5BQ9UGL1 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
KDM5BQ9UGL1 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KDM5BQ9UGL1 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KDM5BQ9UGL1 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KDM5BQ9UGL1 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KDM5BQ9UGL1 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
KDM5BQ9UGL1 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
KDM5BQ9UGL1 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
KDM5BQ9UGL1 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KDM5BQ9UGL1 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
KDM5BQ9UGL1 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KDM5BQ9UGL1 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KDM5BQ9UGL1 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KDM5BQ9UGL1 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
KDM5BQ9UGL1 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KDM5BQ9UGL1 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KDM5BQ9UGL1 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
KDM5BQ9UGL1 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KDM5BQ9UGL1 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KDM5BQ9UGL1 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
KDM5BQ9UGL1 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
KDM5BQ9UGL1 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
KDM5BQ9UGL1 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KDM5BQ9UGL1 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KDM5BQ9UGL1 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KDM5BQ9UGL1 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KDM5BQ9UGL1 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms