Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLIP2Q9UDT6 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLIP2Q9UDT6 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms