Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTNNAL1Q9UBT7 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTNNAL1Q9UBT7 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTNNAL1Q9UBT7 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTNNAL1Q9UBT7 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTNNAL1Q9UBT7 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTNNAL1Q9UBT7 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTNNAL1Q9UBT7 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTNNAL1Q9UBT7 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTNNAL1Q9UBT7 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTNNAL1Q9UBT7 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTNNAL1Q9UBT7 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTNNAL1Q9UBT7 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTNNAL1Q9UBT7 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTNNAL1Q9UBT7 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTNNAL1Q9UBT7 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTNNAL1Q9UBT7 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTNNAL1Q9UBT7 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTNNAL1Q9UBT7 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CTNNAL1Q9UBT7 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTNNAL1Q9UBT7 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTNNAL1Q9UBT7 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTNNAL1Q9UBT7 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTNNAL1Q9UBT7 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTNNAL1Q9UBT7 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTNNAL1Q9UBT7 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTNNAL1Q9UBT7 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTNNAL1Q9UBT7 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTNNAL1Q9UBT7 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTNNAL1Q9UBT7 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTNNAL1Q9UBT7 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTNNAL1Q9UBT7 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTNNAL1Q9UBT7 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTNNAL1Q9UBT7 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTNNAL1Q9UBT7 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTNNAL1Q9UBT7 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTNNAL1Q9UBT7 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CTNNAL1Q9UBT7 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CTNNAL1Q9UBT7 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTNNAL1Q9UBT7 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTNNAL1Q9UBT7 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTNNAL1Q9UBT7 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTNNAL1Q9UBT7 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTNNAL1Q9UBT7 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTNNAL1Q9UBT7 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTNNAL1Q9UBT7 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTNNAL1Q9UBT7 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTNNAL1Q9UBT7 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTNNAL1Q9UBT7 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTNNAL1Q9UBT7 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTNNAL1Q9UBT7 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTNNAL1Q9UBT7 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTNNAL1Q9UBT7 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTNNAL1Q9UBT7 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTNNAL1Q9UBT7 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CTNNAL1Q9UBT7 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CTNNAL1Q9UBT7 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTNNAL1Q9UBT7 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTNNAL1Q9UBT7 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTNNAL1Q9UBT7 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTNNAL1Q9UBT7 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTNNAL1Q9UBT7 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CTNNAL1Q9UBT7 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTNNAL1Q9UBT7 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTNNAL1Q9UBT7 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTNNAL1Q9UBT7 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTNNAL1Q9UBT7 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTNNAL1Q9UBT7 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTNNAL1Q9UBT7 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTNNAL1Q9UBT7 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTNNAL1Q9UBT7 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTNNAL1Q9UBT7 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTNNAL1Q9UBT7 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTNNAL1Q9UBT7 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTNNAL1Q9UBT7 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTNNAL1Q9UBT7 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTNNAL1Q9UBT7 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTNNAL1Q9UBT7 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTNNAL1Q9UBT7 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTNNAL1Q9UBT7 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTNNAL1Q9UBT7 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTNNAL1Q9UBT7 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTNNAL1Q9UBT7 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTNNAL1Q9UBT7 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTNNAL1Q9UBT7 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTNNAL1Q9UBT7 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CTNNAL1Q9UBT7 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CTNNAL1Q9UBT7 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTNNAL1Q9UBT7 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTNNAL1Q9UBT7 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTNNAL1Q9UBT7 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTNNAL1Q9UBT7 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTNNAL1Q9UBT7 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTNNAL1Q9UBT7 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTNNAL1Q9UBT7 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTNNAL1Q9UBT7 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTNNAL1Q9UBT7 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CTNNAL1Q9UBT7 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CTNNAL1Q9UBT7 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms