Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J1

PDP1, [Pyruvate dehydrogenase [acetyl-transferring]]-phosphatase 1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDP1Q9P0J1 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDP1Q9P0J1 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDP1Q9P0J1 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDP1Q9P0J1 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDP1Q9P0J1 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDP1Q9P0J1 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDP1Q9P0J1 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDP1Q9P0J1 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDP1Q9P0J1 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDP1Q9P0J1 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PDP1Q9P0J1 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDP1Q9P0J1 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDP1Q9P0J1 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDP1Q9P0J1 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDP1Q9P0J1 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDP1Q9P0J1 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDP1Q9P0J1 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDP1Q9P0J1 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDP1Q9P0J1 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDP1Q9P0J1 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDP1Q9P0J1 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDP1Q9P0J1 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PDP1Q9P0J1 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDP1Q9P0J1 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDP1Q9P0J1 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDP1Q9P0J1 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDP1Q9P0J1 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDP1Q9P0J1 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDP1Q9P0J1 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDP1Q9P0J1 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PDP1Q9P0J1 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDP1Q9P0J1 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDP1Q9P0J1 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDP1Q9P0J1 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDP1Q9P0J1 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDP1Q9P0J1 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDP1Q9P0J1 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDP1Q9P0J1 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDP1Q9P0J1 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDP1Q9P0J1 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDP1Q9P0J1 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDP1Q9P0J1 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDP1Q9P0J1 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDP1Q9P0J1 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PDP1Q9P0J1 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDP1Q9P0J1 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDP1Q9P0J1 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDP1Q9P0J1 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDP1Q9P0J1 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDP1Q9P0J1 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDP1Q9P0J1 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDP1Q9P0J1 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDP1Q9P0J1 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDP1Q9P0J1 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDP1Q9P0J1 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDP1Q9P0J1 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDP1Q9P0J1 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDP1Q9P0J1 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDP1Q9P0J1 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDP1Q9P0J1 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDP1Q9P0J1 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDP1Q9P0J1 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDP1Q9P0J1 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDP1Q9P0J1 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDP1Q9P0J1 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDP1Q9P0J1 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDP1Q9P0J1 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDP1Q9P0J1 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDP1Q9P0J1 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PDP1Q9P0J1 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDP1Q9P0J1 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDP1Q9P0J1 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDP1Q9P0J1 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDP1Q9P0J1 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDP1Q9P0J1 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDP1Q9P0J1 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDP1Q9P0J1 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDP1Q9P0J1 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDP1Q9P0J1 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDP1Q9P0J1 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDP1Q9P0J1 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDP1Q9P0J1 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDP1Q9P0J1 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDP1Q9P0J1 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDP1Q9P0J1 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDP1Q9P0J1 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDP1Q9P0J1 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDP1Q9P0J1 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDP1Q9P0J1 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDP1Q9P0J1 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDP1Q9P0J1 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDP1Q9P0J1 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDP1Q9P0J1 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDP1Q9P0J1 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDP1Q9P0J1 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDP1Q9P0J1 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDP1Q9P0J1 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDP1Q9P0J1 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDP1Q9P0J1 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PDP1Q9P0J1 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms