Protein–RNA interactions for Protein: Q9P035

HACD3, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD3Q9P035 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HACD3Q9P035 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms