Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW5

CLN6, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6Q9NWW5 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms