Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT99

LRRC4B, Leucine-rich repeat-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC4BQ9NT99 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC4BQ9NT99 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC4BQ9NT99 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC4BQ9NT99 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC4BQ9NT99 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC4BQ9NT99 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC4BQ9NT99 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC4BQ9NT99 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC4BQ9NT99 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC4BQ9NT99 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC4BQ9NT99 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC4BQ9NT99 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC4BQ9NT99 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC4BQ9NT99 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC4BQ9NT99 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC4BQ9NT99 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC4BQ9NT99 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC4BQ9NT99 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC4BQ9NT99 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC4BQ9NT99 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC4BQ9NT99 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC4BQ9NT99 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC4BQ9NT99 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC4BQ9NT99 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC4BQ9NT99 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC4BQ9NT99 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC4BQ9NT99 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC4BQ9NT99 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC4BQ9NT99 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC4BQ9NT99 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC4BQ9NT99 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC4BQ9NT99 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC4BQ9NT99 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC4BQ9NT99 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC4BQ9NT99 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC4BQ9NT99 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC4BQ9NT99 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC4BQ9NT99 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC4BQ9NT99 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC4BQ9NT99 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC4BQ9NT99 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC4BQ9NT99 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC4BQ9NT99 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC4BQ9NT99 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC4BQ9NT99 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC4BQ9NT99 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC4BQ9NT99 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC4BQ9NT99 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC4BQ9NT99 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC4BQ9NT99 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC4BQ9NT99 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC4BQ9NT99 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC4BQ9NT99 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC4BQ9NT99 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC4BQ9NT99 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC4BQ9NT99 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC4BQ9NT99 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC4BQ9NT99 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC4BQ9NT99 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC4BQ9NT99 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC4BQ9NT99 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC4BQ9NT99 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC4BQ9NT99 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC4BQ9NT99 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC4BQ9NT99 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC4BQ9NT99 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC4BQ9NT99 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC4BQ9NT99 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC4BQ9NT99 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC4BQ9NT99 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC4BQ9NT99 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC4BQ9NT99 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC4BQ9NT99 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC4BQ9NT99 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC4BQ9NT99 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC4BQ9NT99 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC4BQ9NT99 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC4BQ9NT99 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC4BQ9NT99 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC4BQ9NT99 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC4BQ9NT99 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC4BQ9NT99 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC4BQ9NT99 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC4BQ9NT99 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC4BQ9NT99 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC4BQ9NT99 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC4BQ9NT99 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC4BQ9NT99 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC4BQ9NT99 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC4BQ9NT99 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC4BQ9NT99 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC4BQ9NT99 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC4BQ9NT99 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC4BQ9NT99 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC4BQ9NT99 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC4BQ9NT99 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC4BQ9NT99 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC4BQ9NT99 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC4BQ9NT99 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC4BQ9NT99 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms