Protein–RNA interactions for Protein: Q9NST1

PNPLA3, Patatin-like phospholipase domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA3Q9NST1 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PNPLA3Q9NST1 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms