Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD15

SRA1, Steroid receptor RNA activator 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRA1Q9HD15 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRA1Q9HD15 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRA1Q9HD15 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRA1Q9HD15 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SRA1Q9HD15 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SRA1Q9HD15 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SRA1Q9HD15 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SRA1Q9HD15 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SRA1Q9HD15 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SRA1Q9HD15 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SRA1Q9HD15 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SRA1Q9HD15 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SRA1Q9HD15 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRA1Q9HD15 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRA1Q9HD15 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRA1Q9HD15 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRA1Q9HD15 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRA1Q9HD15 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SRA1Q9HD15 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRA1Q9HD15 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRA1Q9HD15 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRA1Q9HD15 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRA1Q9HD15 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRA1Q9HD15 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRA1Q9HD15 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRA1Q9HD15 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRA1Q9HD15 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRA1Q9HD15 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRA1Q9HD15 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRA1Q9HD15 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRA1Q9HD15 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SRA1Q9HD15 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SRA1Q9HD15 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRA1Q9HD15 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRA1Q9HD15 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SRA1Q9HD15 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRA1Q9HD15 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRA1Q9HD15 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRA1Q9HD15 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SRA1Q9HD15 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRA1Q9HD15 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRA1Q9HD15 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRA1Q9HD15 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRA1Q9HD15 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRA1Q9HD15 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRA1Q9HD15 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SRA1Q9HD15 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRA1Q9HD15 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRA1Q9HD15 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRA1Q9HD15 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRA1Q9HD15 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRA1Q9HD15 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRA1Q9HD15 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRA1Q9HD15 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRA1Q9HD15 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRA1Q9HD15 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRA1Q9HD15 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRA1Q9HD15 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRA1Q9HD15 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRA1Q9HD15 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRA1Q9HD15 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRA1Q9HD15 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRA1Q9HD15 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRA1Q9HD15 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRA1Q9HD15 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRA1Q9HD15 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRA1Q9HD15 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRA1Q9HD15 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRA1Q9HD15 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRA1Q9HD15 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRA1Q9HD15 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRA1Q9HD15 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRA1Q9HD15 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRA1Q9HD15 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRA1Q9HD15 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRA1Q9HD15 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRA1Q9HD15 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SRA1Q9HD15 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRA1Q9HD15 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRA1Q9HD15 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRA1Q9HD15 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRA1Q9HD15 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRA1Q9HD15 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRA1Q9HD15 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRA1Q9HD15 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRA1Q9HD15 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRA1Q9HD15 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRA1Q9HD15 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRA1Q9HD15 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRA1Q9HD15 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRA1Q9HD15 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRA1Q9HD15 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRA1Q9HD15 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRA1Q9HD15 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRA1Q9HD15 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRA1Q9HD15 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRA1Q9HD15 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRA1Q9HD15 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRA1Q9HD15 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SRA1Q9HD15 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms