Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN8

C20orf27, UPF0687 protein C20orf27, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C20orf27Q9GZN8 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
C20orf27Q9GZN8 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
C20orf27Q9GZN8 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
C20orf27Q9GZN8 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
C20orf27Q9GZN8 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C20orf27Q9GZN8 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C20orf27Q9GZN8 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
C20orf27Q9GZN8 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
C20orf27Q9GZN8 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C20orf27Q9GZN8 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C20orf27Q9GZN8 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C20orf27Q9GZN8 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C20orf27Q9GZN8 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C20orf27Q9GZN8 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C20orf27Q9GZN8 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C20orf27Q9GZN8 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
C20orf27Q9GZN8 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
C20orf27Q9GZN8 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
C20orf27Q9GZN8 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
C20orf27Q9GZN8 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
C20orf27Q9GZN8 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C20orf27Q9GZN8 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
C20orf27Q9GZN8 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C20orf27Q9GZN8 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C20orf27Q9GZN8 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
C20orf27Q9GZN8 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C20orf27Q9GZN8 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C20orf27Q9GZN8 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C20orf27Q9GZN8 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C20orf27Q9GZN8 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C20orf27Q9GZN8 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C20orf27Q9GZN8 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C20orf27Q9GZN8 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C20orf27Q9GZN8 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C20orf27Q9GZN8 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C20orf27Q9GZN8 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C20orf27Q9GZN8 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C20orf27Q9GZN8 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C20orf27Q9GZN8 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C20orf27Q9GZN8 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C20orf27Q9GZN8 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C20orf27Q9GZN8 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C20orf27Q9GZN8 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C20orf27Q9GZN8 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C20orf27Q9GZN8 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C20orf27Q9GZN8 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C20orf27Q9GZN8 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C20orf27Q9GZN8 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C20orf27Q9GZN8 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C20orf27Q9GZN8 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C20orf27Q9GZN8 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C20orf27Q9GZN8 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C20orf27Q9GZN8 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C20orf27Q9GZN8 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C20orf27Q9GZN8 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C20orf27Q9GZN8 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C20orf27Q9GZN8 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C20orf27Q9GZN8 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C20orf27Q9GZN8 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C20orf27Q9GZN8 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C20orf27Q9GZN8 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C20orf27Q9GZN8 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C20orf27Q9GZN8 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C20orf27Q9GZN8 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C20orf27Q9GZN8 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C20orf27Q9GZN8 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C20orf27Q9GZN8 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C20orf27Q9GZN8 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C20orf27Q9GZN8 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C20orf27Q9GZN8 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C20orf27Q9GZN8 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C20orf27Q9GZN8 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C20orf27Q9GZN8 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C20orf27Q9GZN8 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C20orf27Q9GZN8 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C20orf27Q9GZN8 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C20orf27Q9GZN8 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
C20orf27Q9GZN8 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C20orf27Q9GZN8 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C20orf27Q9GZN8 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C20orf27Q9GZN8 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C20orf27Q9GZN8 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C20orf27Q9GZN8 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C20orf27Q9GZN8 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
C20orf27Q9GZN8 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C20orf27Q9GZN8 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C20orf27Q9GZN8 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C20orf27Q9GZN8 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C20orf27Q9GZN8 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C20orf27Q9GZN8 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C20orf27Q9GZN8 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C20orf27Q9GZN8 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C20orf27Q9GZN8 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C20orf27Q9GZN8 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C20orf27Q9GZN8 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C20orf27Q9GZN8 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C20orf27Q9GZN8 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C20orf27Q9GZN8 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C20orf27Q9GZN8 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C20orf27Q9GZN8 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms