Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCSER1Q9C0I3 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCSER1Q9C0I3 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCSER1Q9C0I3 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCSER1Q9C0I3 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CCSER1Q9C0I3 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCSER1Q9C0I3 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCSER1Q9C0I3 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCSER1Q9C0I3 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCSER1Q9C0I3 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCSER1Q9C0I3 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCSER1Q9C0I3 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCSER1Q9C0I3 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCSER1Q9C0I3 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCSER1Q9C0I3 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCSER1Q9C0I3 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCSER1Q9C0I3 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCSER1Q9C0I3 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CCSER1Q9C0I3 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCSER1Q9C0I3 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCSER1Q9C0I3 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCSER1Q9C0I3 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCSER1Q9C0I3 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCSER1Q9C0I3 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCSER1Q9C0I3 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCSER1Q9C0I3 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCSER1Q9C0I3 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCSER1Q9C0I3 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCSER1Q9C0I3 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCSER1Q9C0I3 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCSER1Q9C0I3 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCSER1Q9C0I3 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCSER1Q9C0I3 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCSER1Q9C0I3 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCSER1Q9C0I3 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CCSER1Q9C0I3 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCSER1Q9C0I3 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CCSER1Q9C0I3 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCSER1Q9C0I3 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCSER1Q9C0I3 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCSER1Q9C0I3 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCSER1Q9C0I3 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCSER1Q9C0I3 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCSER1Q9C0I3 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCSER1Q9C0I3 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCSER1Q9C0I3 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCSER1Q9C0I3 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCSER1Q9C0I3 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCSER1Q9C0I3 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCSER1Q9C0I3 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCSER1Q9C0I3 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCSER1Q9C0I3 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCSER1Q9C0I3 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCSER1Q9C0I3 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCSER1Q9C0I3 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCSER1Q9C0I3 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCSER1Q9C0I3 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCSER1Q9C0I3 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCSER1Q9C0I3 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCSER1Q9C0I3 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCSER1Q9C0I3 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCSER1Q9C0I3 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCSER1Q9C0I3 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCSER1Q9C0I3 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCSER1Q9C0I3 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCSER1Q9C0I3 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCSER1Q9C0I3 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCSER1Q9C0I3 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCSER1Q9C0I3 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCSER1Q9C0I3 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCSER1Q9C0I3 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCSER1Q9C0I3 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCSER1Q9C0I3 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCSER1Q9C0I3 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCSER1Q9C0I3 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCSER1Q9C0I3 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCSER1Q9C0I3 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCSER1Q9C0I3 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCSER1Q9C0I3 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCSER1Q9C0I3 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CCSER1Q9C0I3 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CCSER1Q9C0I3 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCSER1Q9C0I3 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCSER1Q9C0I3 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCSER1Q9C0I3 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCSER1Q9C0I3 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCSER1Q9C0I3 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCSER1Q9C0I3 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCSER1Q9C0I3 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCSER1Q9C0I3 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCSER1Q9C0I3 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCSER1Q9C0I3 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCSER1Q9C0I3 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCSER1Q9C0I3 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCSER1Q9C0I3 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCSER1Q9C0I3 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCSER1Q9C0I3 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCSER1Q9C0I3 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CCSER1Q9C0I3 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCSER1Q9C0I3 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
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