Protein–RNA interactions for Protein: Q9C099

LRRCC1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRCC1Q9C099 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
LRRCC1Q9C099 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRCC1Q9C099 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms