Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW85

CCDC94, Coiled-coil domain-containing protein 94, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC94Q9BW85 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC94Q9BW85 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC94Q9BW85 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC94Q9BW85 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC94Q9BW85 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC94Q9BW85 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC94Q9BW85 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC94Q9BW85 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC94Q9BW85 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC94Q9BW85 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC94Q9BW85 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC94Q9BW85 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC94Q9BW85 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC94Q9BW85 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC94Q9BW85 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC94Q9BW85 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC94Q9BW85 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC94Q9BW85 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC94Q9BW85 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC94Q9BW85 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC94Q9BW85 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC94Q9BW85 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC94Q9BW85 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC94Q9BW85 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC94Q9BW85 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC94Q9BW85 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC94Q9BW85 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC94Q9BW85 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC94Q9BW85 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC94Q9BW85 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC94Q9BW85 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC94Q9BW85 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC94Q9BW85 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC94Q9BW85 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC94Q9BW85 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC94Q9BW85 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC94Q9BW85 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC94Q9BW85 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC94Q9BW85 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC94Q9BW85 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC94Q9BW85 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC94Q9BW85 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC94Q9BW85 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC94Q9BW85 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC94Q9BW85 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC94Q9BW85 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC94Q9BW85 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC94Q9BW85 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC94Q9BW85 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC94Q9BW85 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC94Q9BW85 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC94Q9BW85 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC94Q9BW85 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC94Q9BW85 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC94Q9BW85 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC94Q9BW85 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC94Q9BW85 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC94Q9BW85 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC94Q9BW85 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC94Q9BW85 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC94Q9BW85 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC94Q9BW85 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC94Q9BW85 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC94Q9BW85 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC94Q9BW85 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC94Q9BW85 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC94Q9BW85 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC94Q9BW85 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC94Q9BW85 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC94Q9BW85 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC94Q9BW85 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC94Q9BW85 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC94Q9BW85 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC94Q9BW85 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC94Q9BW85 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC94Q9BW85 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC94Q9BW85 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC94Q9BW85 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC94Q9BW85 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC94Q9BW85 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC94Q9BW85 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC94Q9BW85 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC94Q9BW85 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC94Q9BW85 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC94Q9BW85 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC94Q9BW85 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC94Q9BW85 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC94Q9BW85 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC94Q9BW85 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC94Q9BW85 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC94Q9BW85 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC94Q9BW85 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC94Q9BW85 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC94Q9BW85 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC94Q9BW85 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC94Q9BW85 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC94Q9BW85 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC94Q9BW85 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC94Q9BW85 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC94Q9BW85 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms