Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTV4

TMEM43, Transmembrane protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM43Q9BTV4 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM43Q9BTV4 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM43Q9BTV4 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms