Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSM1

PCGF1, Polycomb group RING finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF1Q9BSM1 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCGF1Q9BSM1 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCGF1Q9BSM1 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCGF1Q9BSM1 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCGF1Q9BSM1 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCGF1Q9BSM1 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCGF1Q9BSM1 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PCGF1Q9BSM1 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCGF1Q9BSM1 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCGF1Q9BSM1 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCGF1Q9BSM1 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCGF1Q9BSM1 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCGF1Q9BSM1 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PCGF1Q9BSM1 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCGF1Q9BSM1 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCGF1Q9BSM1 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCGF1Q9BSM1 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCGF1Q9BSM1 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCGF1Q9BSM1 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCGF1Q9BSM1 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCGF1Q9BSM1 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCGF1Q9BSM1 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCGF1Q9BSM1 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCGF1Q9BSM1 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCGF1Q9BSM1 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCGF1Q9BSM1 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCGF1Q9BSM1 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCGF1Q9BSM1 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCGF1Q9BSM1 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PCGF1Q9BSM1 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCGF1Q9BSM1 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCGF1Q9BSM1 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCGF1Q9BSM1 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCGF1Q9BSM1 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCGF1Q9BSM1 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCGF1Q9BSM1 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCGF1Q9BSM1 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCGF1Q9BSM1 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCGF1Q9BSM1 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCGF1Q9BSM1 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCGF1Q9BSM1 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PCGF1Q9BSM1 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PCGF1Q9BSM1 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCGF1Q9BSM1 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCGF1Q9BSM1 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCGF1Q9BSM1 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCGF1Q9BSM1 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCGF1Q9BSM1 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCGF1Q9BSM1 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCGF1Q9BSM1 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCGF1Q9BSM1 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCGF1Q9BSM1 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCGF1Q9BSM1 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PCGF1Q9BSM1 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCGF1Q9BSM1 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCGF1Q9BSM1 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PCGF1Q9BSM1 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCGF1Q9BSM1 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCGF1Q9BSM1 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PCGF1Q9BSM1 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCGF1Q9BSM1 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCGF1Q9BSM1 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCGF1Q9BSM1 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCGF1Q9BSM1 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCGF1Q9BSM1 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCGF1Q9BSM1 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCGF1Q9BSM1 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PCGF1Q9BSM1 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCGF1Q9BSM1 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCGF1Q9BSM1 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCGF1Q9BSM1 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCGF1Q9BSM1 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCGF1Q9BSM1 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCGF1Q9BSM1 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCGF1Q9BSM1 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCGF1Q9BSM1 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCGF1Q9BSM1 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCGF1Q9BSM1 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCGF1Q9BSM1 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCGF1Q9BSM1 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCGF1Q9BSM1 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCGF1Q9BSM1 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCGF1Q9BSM1 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCGF1Q9BSM1 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCGF1Q9BSM1 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCGF1Q9BSM1 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCGF1Q9BSM1 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCGF1Q9BSM1 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCGF1Q9BSM1 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCGF1Q9BSM1 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCGF1Q9BSM1 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCGF1Q9BSM1 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCGF1Q9BSM1 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCGF1Q9BSM1 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCGF1Q9BSM1 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PCGF1Q9BSM1 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCGF1Q9BSM1 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCGF1Q9BSM1 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PCGF1Q9BSM1 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PCGF1Q9BSM1 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms