Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR84

ZNF559, Zinc finger protein 559, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF559Q9BR84 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ZNF559Q9BR84 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms