Protein–RNA interactions for Protein: Q99836

MYD88, Myeloid differentiation primary response protein MyD88, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYD88Q99836 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MYD88Q99836 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MYD88Q99836 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MYD88Q99836 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MYD88Q99836 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MYD88Q99836 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
MYD88Q99836 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
MYD88Q99836 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MYD88Q99836 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MYD88Q99836 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MYD88Q99836 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MYD88Q99836 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MYD88Q99836 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MYD88Q99836 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MYD88Q99836 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MYD88Q99836 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MYD88Q99836 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MYD88Q99836 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MYD88Q99836 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
MYD88Q99836 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MYD88Q99836 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MYD88Q99836 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MYD88Q99836 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MYD88Q99836 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MYD88Q99836 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MYD88Q99836 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MYD88Q99836 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MYD88Q99836 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MYD88Q99836 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MYD88Q99836 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MYD88Q99836 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MYD88Q99836 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MYD88Q99836 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MYD88Q99836 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MYD88Q99836 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MYD88Q99836 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MYD88Q99836 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MYD88Q99836 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MYD88Q99836 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MYD88Q99836 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MYD88Q99836 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MYD88Q99836 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MYD88Q99836 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MYD88Q99836 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MYD88Q99836 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MYD88Q99836 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MYD88Q99836 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MYD88Q99836 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MYD88Q99836 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MYD88Q99836 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MYD88Q99836 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MYD88Q99836 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MYD88Q99836 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MYD88Q99836 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MYD88Q99836 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MYD88Q99836 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MYD88Q99836 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MYD88Q99836 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MYD88Q99836 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MYD88Q99836 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MYD88Q99836 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MYD88Q99836 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MYD88Q99836 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MYD88Q99836 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MYD88Q99836 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MYD88Q99836 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
MYD88Q99836 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MYD88Q99836 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MYD88Q99836 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MYD88Q99836 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MYD88Q99836 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MYD88Q99836 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MYD88Q99836 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MYD88Q99836 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MYD88Q99836 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
MYD88Q99836 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MYD88Q99836 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MYD88Q99836 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MYD88Q99836 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MYD88Q99836 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MYD88Q99836 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MYD88Q99836 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
MYD88Q99836 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MYD88Q99836 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MYD88Q99836 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms