Protein–RNA interactions for Protein: Q96RQ3

MCCC1, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCC1Q96RQ3 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCCC1Q96RQ3 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCCC1Q96RQ3 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
MCCC1Q96RQ3 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCCC1Q96RQ3 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCCC1Q96RQ3 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCCC1Q96RQ3 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCCC1Q96RQ3 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCCC1Q96RQ3 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCCC1Q96RQ3 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCCC1Q96RQ3 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCCC1Q96RQ3 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCCC1Q96RQ3 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCCC1Q96RQ3 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCCC1Q96RQ3 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCCC1Q96RQ3 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCCC1Q96RQ3 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCCC1Q96RQ3 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCCC1Q96RQ3 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCCC1Q96RQ3 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCCC1Q96RQ3 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCCC1Q96RQ3 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCCC1Q96RQ3 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCCC1Q96RQ3 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCCC1Q96RQ3 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCCC1Q96RQ3 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
MCCC1Q96RQ3 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCCC1Q96RQ3 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
MCCC1Q96RQ3 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCCC1Q96RQ3 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCCC1Q96RQ3 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCCC1Q96RQ3 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
MCCC1Q96RQ3 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCCC1Q96RQ3 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MCCC1Q96RQ3 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms